臺灣磁共振人才及各方面條件皆相當不錯，但欲舉辦磁共振領域的國際會議時，卻無對應的組織單位，有鑑於此，臺灣磁共振學會於民國94年3月舉行了第一次的籌備會議，並於同年5月28日於中央研究院原子與分子科學研究所舉行成立大會及第一次會員大會，臺灣磁共振學會正式成立。
本會的宗旨在促進國內、外磁共振研究學者間之交流，提昇磁共振學術研究水準，有助於相關產業之升級及醫學技術之發展，增進國人福祉。竭誠歡迎從事NMR,MRI,EPR及磁共振相關基礎及應用研究之學術界、產界和社會人士加入本學會。
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